Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
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Pkn3Q8K045 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Pkn3Q8K045 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Pkn3Q8K045 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Pkn3Q8K045 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Pkn3Q8K045 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Pkn3Q8K045 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Pkn3Q8K045 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Pkn3Q8K045 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Pkn3Q8K045 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Pkn3Q8K045 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pkn3Q8K045 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms