Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIF4

Btd, Biotinidase, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BtdQ8CIF4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BtdQ8CIF4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BtdQ8CIF4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BtdQ8CIF4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BtdQ8CIF4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BtdQ8CIF4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BtdQ8CIF4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BtdQ8CIF4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BtdQ8CIF4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BtdQ8CIF4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BtdQ8CIF4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BtdQ8CIF4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BtdQ8CIF4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BtdQ8CIF4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BtdQ8CIF4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BtdQ8CIF4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BtdQ8CIF4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BtdQ8CIF4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BtdQ8CIF4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
BtdQ8CIF4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BtdQ8CIF4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BtdQ8CIF4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BtdQ8CIF4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BtdQ8CIF4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BtdQ8CIF4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BtdQ8CIF4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
BtdQ8CIF4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BtdQ8CIF4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BtdQ8CIF4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BtdQ8CIF4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BtdQ8CIF4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
BtdQ8CIF4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BtdQ8CIF4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BtdQ8CIF4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BtdQ8CIF4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BtdQ8CIF4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BtdQ8CIF4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BtdQ8CIF4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BtdQ8CIF4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BtdQ8CIF4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BtdQ8CIF4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BtdQ8CIF4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BtdQ8CIF4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BtdQ8CIF4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BtdQ8CIF4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BtdQ8CIF4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BtdQ8CIF4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BtdQ8CIF4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BtdQ8CIF4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BtdQ8CIF4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
BtdQ8CIF4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
BtdQ8CIF4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BtdQ8CIF4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BtdQ8CIF4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BtdQ8CIF4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BtdQ8CIF4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BtdQ8CIF4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BtdQ8CIF4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BtdQ8CIF4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BtdQ8CIF4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BtdQ8CIF4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BtdQ8CIF4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BtdQ8CIF4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BtdQ8CIF4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BtdQ8CIF4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BtdQ8CIF4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BtdQ8CIF4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BtdQ8CIF4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BtdQ8CIF4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BtdQ8CIF4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BtdQ8CIF4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BtdQ8CIF4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BtdQ8CIF4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BtdQ8CIF4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BtdQ8CIF4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BtdQ8CIF4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BtdQ8CIF4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BtdQ8CIF4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BtdQ8CIF4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BtdQ8CIF4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BtdQ8CIF4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BtdQ8CIF4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BtdQ8CIF4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BtdQ8CIF4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BtdQ8CIF4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BtdQ8CIF4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BtdQ8CIF4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BtdQ8CIF4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BtdQ8CIF4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BtdQ8CIF4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BtdQ8CIF4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BtdQ8CIF4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BtdQ8CIF4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BtdQ8CIF4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BtdQ8CIF4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BtdQ8CIF4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BtdQ8CIF4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BtdQ8CIF4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BtdQ8CIF4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BtdQ8CIF4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms