Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms