Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Setd1bQ8CFT2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Setd1bQ8CFT2 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Setd1bQ8CFT2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Setd1bQ8CFT2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Setd1bQ8CFT2 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Setd1bQ8CFT2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Setd1bQ8CFT2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Setd1bQ8CFT2 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Setd1bQ8CFT2 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Setd1bQ8CFT2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Setd1bQ8CFT2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Setd1bQ8CFT2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Setd1bQ8CFT2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Setd1bQ8CFT2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Setd1bQ8CFT2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Setd1bQ8CFT2 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Setd1bQ8CFT2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Setd1bQ8CFT2 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Setd1bQ8CFT2 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Setd1bQ8CFT2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Setd1bQ8CFT2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Setd1bQ8CFT2 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Setd1bQ8CFT2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Setd1bQ8CFT2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Setd1bQ8CFT2 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Setd1bQ8CFT2 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Setd1bQ8CFT2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Setd1bQ8CFT2 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Setd1bQ8CFT2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms