Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Pramef8Q8CE24 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Pramef8Q8CE24 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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Pramef8Q8CE24 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Pramef8Q8CE24 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Pramef8Q8CE24 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms