Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc17Q8CE13 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms