Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc178Q8CDV0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc178Q8CDV0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc178Q8CDV0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc178Q8CDV0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc178Q8CDV0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc178Q8CDV0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc178Q8CDV0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc178Q8CDV0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc178Q8CDV0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc178Q8CDV0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc178Q8CDV0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc178Q8CDV0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc178Q8CDV0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc178Q8CDV0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc178Q8CDV0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc178Q8CDV0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc178Q8CDV0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms