Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc87Q8CDL9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms