Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3W1

Uncharacterized protein C1orf198 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C3W1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C3W1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C3W1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C3W1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C3W1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C3W1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C3W1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C3W1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C3W1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C3W1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C3W1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C3W1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C3W1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms