Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdac7Q8C2B3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac7Q8C2B3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms