Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Iffo1Q8BXL9 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Iffo1Q8BXL9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Iffo1Q8BXL9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Iffo1Q8BXL9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Iffo1Q8BXL9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Iffo1Q8BXL9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Iffo1Q8BXL9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Iffo1Q8BXL9 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Iffo1Q8BXL9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Iffo1Q8BXL9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Iffo1Q8BXL9 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Iffo1Q8BXL9 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Iffo1Q8BXL9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Iffo1Q8BXL9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Iffo1Q8BXL9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Iffo1Q8BXL9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Iffo1Q8BXL9 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Iffo1Q8BXL9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Iffo1Q8BXL9 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Iffo1Q8BXL9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Iffo1Q8BXL9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Iffo1Q8BXL9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Iffo1Q8BXL9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
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