Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TtpaQ8BWP5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms