Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Usp38Q8BW70 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Usp38Q8BW70 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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