Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVW3

Trim14, Tripartite motif-containing protein 14, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim14Q8BVW3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim14Q8BVW3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim14Q8BVW3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim14Q8BVW3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim14Q8BVW3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim14Q8BVW3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim14Q8BVW3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim14Q8BVW3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim14Q8BVW3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim14Q8BVW3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim14Q8BVW3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim14Q8BVW3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim14Q8BVW3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim14Q8BVW3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim14Q8BVW3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim14Q8BVW3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim14Q8BVW3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim14Q8BVW3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim14Q8BVW3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim14Q8BVW3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim14Q8BVW3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim14Q8BVW3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim14Q8BVW3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim14Q8BVW3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim14Q8BVW3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim14Q8BVW3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim14Q8BVW3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim14Q8BVW3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim14Q8BVW3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim14Q8BVW3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim14Q8BVW3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim14Q8BVW3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim14Q8BVW3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim14Q8BVW3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim14Q8BVW3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim14Q8BVW3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim14Q8BVW3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim14Q8BVW3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim14Q8BVW3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim14Q8BVW3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim14Q8BVW3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim14Q8BVW3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim14Q8BVW3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim14Q8BVW3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim14Q8BVW3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim14Q8BVW3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim14Q8BVW3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim14Q8BVW3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim14Q8BVW3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim14Q8BVW3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim14Q8BVW3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim14Q8BVW3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim14Q8BVW3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim14Q8BVW3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim14Q8BVW3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim14Q8BVW3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim14Q8BVW3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim14Q8BVW3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim14Q8BVW3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim14Q8BVW3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim14Q8BVW3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim14Q8BVW3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim14Q8BVW3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim14Q8BVW3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim14Q8BVW3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim14Q8BVW3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim14Q8BVW3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim14Q8BVW3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim14Q8BVW3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim14Q8BVW3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim14Q8BVW3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim14Q8BVW3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim14Q8BVW3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim14Q8BVW3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim14Q8BVW3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim14Q8BVW3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim14Q8BVW3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim14Q8BVW3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim14Q8BVW3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim14Q8BVW3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim14Q8BVW3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim14Q8BVW3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim14Q8BVW3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim14Q8BVW3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim14Q8BVW3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim14Q8BVW3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim14Q8BVW3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim14Q8BVW3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim14Q8BVW3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim14Q8BVW3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim14Q8BVW3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim14Q8BVW3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim14Q8BVW3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim14Q8BVW3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim14Q8BVW3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim14Q8BVW3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim14Q8BVW3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim14Q8BVW3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim14Q8BVW3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim14Q8BVW3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms