Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSU2

Cxcl16, C-X-C motif chemokine 16, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl16Q8BSU2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl16Q8BSU2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl16Q8BSU2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl16Q8BSU2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl16Q8BSU2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl16Q8BSU2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl16Q8BSU2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl16Q8BSU2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl16Q8BSU2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl16Q8BSU2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl16Q8BSU2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl16Q8BSU2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl16Q8BSU2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl16Q8BSU2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl16Q8BSU2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Cxcl16Q8BSU2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms