Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ2

Gtf3c4, General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4Q8BMQ2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms