Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMK4

Ckap4, Cytoskeleton-associated protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap4Q8BMK4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ckap4Q8BMK4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms