Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gga3Q8BMI3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms