Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdca8Q8BHX3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms