Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGD6

Slc38a9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a9Q8BGD6 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc38a9Q8BGD6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc38a9Q8BGD6 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc38a9Q8BGD6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc38a9Q8BGD6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc38a9Q8BGD6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc38a9Q8BGD6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc38a9Q8BGD6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc38a9Q8BGD6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc38a9Q8BGD6 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc38a9Q8BGD6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc38a9Q8BGD6 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc38a9Q8BGD6 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc38a9Q8BGD6 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc38a9Q8BGD6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc38a9Q8BGD6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc38a9Q8BGD6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc38a9Q8BGD6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc38a9Q8BGD6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc38a9Q8BGD6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc38a9Q8BGD6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc38a9Q8BGD6 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc38a9Q8BGD6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc38a9Q8BGD6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc38a9Q8BGD6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc38a9Q8BGD6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc38a9Q8BGD6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc38a9Q8BGD6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc38a9Q8BGD6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc38a9Q8BGD6 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc38a9Q8BGD6 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc38a9Q8BGD6 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc38a9Q8BGD6 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc38a9Q8BGD6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc38a9Q8BGD6 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc38a9Q8BGD6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc38a9Q8BGD6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc38a9Q8BGD6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms