Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8BGC1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8BGC1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8BGC1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8BGC1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8BGC1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms