Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NfascQ810U3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms