Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc172Q810N9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc172Q810N9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms