Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cracr2bQ80ZJ8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms