Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NanogQ80Z64 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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NanogQ80Z64 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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NanogQ80Z64 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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NanogQ80Z64 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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NanogQ80Z64 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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NanogQ80Z64 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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NanogQ80Z64 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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NanogQ80Z64 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NanogQ80Z64 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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