Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ttc28Q80XJ3 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ttc28Q80XJ3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ttc28Q80XJ3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ttc28Q80XJ3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ttc28Q80XJ3 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ttc28Q80XJ3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ttc28Q80XJ3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ttc28Q80XJ3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ttc28Q80XJ3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ttc28Q80XJ3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ttc28Q80XJ3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ttc28Q80XJ3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ttc28Q80XJ3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ttc28Q80XJ3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ttc28Q80XJ3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms