Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms