Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms