Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSK3

Pcdh8, Protocadherin-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh8Q7TSK3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pcdh8Q7TSK3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms