Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LnpkQ7TQ95 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LnpkQ7TQ95 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms