Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prrc2bQ7TPM1 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms