Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNM2

Trim46, Tripartite motif-containing protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim46Q7TNM2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim46Q7TNM2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim46Q7TNM2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim46Q7TNM2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim46Q7TNM2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim46Q7TNM2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim46Q7TNM2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim46Q7TNM2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim46Q7TNM2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim46Q7TNM2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
Trim46Q7TNM2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim46Q7TNM2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms