Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp397Q7TNK4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms