Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms