Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Shq1Q7TMX5 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shq1Q7TMX5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms