Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp34Q6ZQ93 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms