Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cnot1Q6ZQ08 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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