Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms