Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Timd4Q6U7R4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Timd4Q6U7R4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Timd4Q6U7R4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Timd4Q6U7R4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Timd4Q6U7R4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Timd4Q6U7R4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Timd4Q6U7R4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Timd4Q6U7R4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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Timd4Q6U7R4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Timd4Q6U7R4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Timd4Q6U7R4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Timd4Q6U7R4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Timd4Q6U7R4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Timd4Q6U7R4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Timd4Q6U7R4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Timd4Q6U7R4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Timd4Q6U7R4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Timd4Q6U7R4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Timd4Q6U7R4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Timd4Q6U7R4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Timd4Q6U7R4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Timd4Q6U7R4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Timd4Q6U7R4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Timd4Q6U7R4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Timd4Q6U7R4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Timd4Q6U7R4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Timd4Q6U7R4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Timd4Q6U7R4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Timd4Q6U7R4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Timd4Q6U7R4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Timd4Q6U7R4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Timd4Q6U7R4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Timd4Q6U7R4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Timd4Q6U7R4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Timd4Q6U7R4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Timd4Q6U7R4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Timd4Q6U7R4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Timd4Q6U7R4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Timd4Q6U7R4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Timd4Q6U7R4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Timd4Q6U7R4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Timd4Q6U7R4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Timd4Q6U7R4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Timd4Q6U7R4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Timd4Q6U7R4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Timd4Q6U7R4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Timd4Q6U7R4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Timd4Q6U7R4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Timd4Q6U7R4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Timd4Q6U7R4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Timd4Q6U7R4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Timd4Q6U7R4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Timd4Q6U7R4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Timd4Q6U7R4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Timd4Q6U7R4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Timd4Q6U7R4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Timd4Q6U7R4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Timd4Q6U7R4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Timd4Q6U7R4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Timd4Q6U7R4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Timd4Q6U7R4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Timd4Q6U7R4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms