Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms