Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE13

Prrt3, Proline-rich transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt3Q6PE13 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt3Q6PE13 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms