Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS3

Sarm1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sarm1Q6PDS3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms