Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC8

Mfsd4a, Major facilitator superfamily domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4aQ6PDC8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Mfsd4aQ6PDC8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms