Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms