Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T2

Snrnp200, U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp200Q6P4T2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrnp200Q6P4T2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrnp200Q6P4T2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrnp200Q6P4T2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrnp200Q6P4T2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrnp200Q6P4T2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrnp200Q6P4T2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrnp200Q6P4T2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrnp200Q6P4T2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrnp200Q6P4T2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrnp200Q6P4T2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrnp200Q6P4T2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrnp200Q6P4T2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrnp200Q6P4T2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrnp200Q6P4T2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrnp200Q6P4T2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms