Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A8

Bckdhb, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhbQ6P3A8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BckdhbQ6P3A8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms