Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1G2

Kdm2b, Lysine-specific demethylase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2bQ6P1G2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kdm2bQ6P1G2 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms