Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rprd2Q6NXI6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms