Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms