Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdcd11Q6NS46 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdcd11Q6NS46 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms